You are here

Home » Content

Multidisipliner yeni bir bilim dalı: biyoinformatik ve tıpta uygulamaları

Journal Name:

  • Süleyman Demirel Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi

Publication Year:

  • 2009

Key Words:

Keywords (Original Language):

Author NameUniversity of AuthorFaculty of Author
Abstract (2. Language): 
A healthy evaluation of the information gathered on biological systems and incidents is possible due to bioinformatics, a new and interdisciplinary scientific branch growing out of the integration of medicine, biochemistry, chemistry, informatics, math and statistics as well as biology. Bioinformatics is based on making use of informatics technologies in order to solve biological problems and helps biological events to be explained at a molecular level. Bioinformatics is theation of databases in order to create and store biological information. Bioinformatics play an important role in medical sciences. Recent applications in medical sciences have focused on gene expression analyses. In general, expressions of cells that are affected from different diseases are compiled and compared to those of healthy cells and differences between them are used to diagnose the disease and design the target medicine. Through this, it could be possible to design the components that can be attached the protein subject to expression, and what is more, transcription regulators causing change in expression level can be determined. In this context, what the points at issue are that micro-array experiments are carried out, and response is assessed in pharmacological practices, thus obtaining pre-information on toxicity of the medicines to be tested. In this compilation, we have tried to explain the use of bioinformatics, a very recent scientific branch, in medicine and pharmacology.
Bookmark/Search this post with
Abstract (Original Language): 
Biyolojik sistemler ve olaylar hakkında toplanan bilgilerin sağlıklı biçimde değerlendirilmesi; biyoloji yanında biyokimya, kimya ve tıp ile bilişim bilimleri, matematik ve istatistiğin entegrasyonunun sonucu doğan yeni ve interdisipliner bir bilim dalı olan biyoinformatik sayesinde mümkündür. Biyoinformatik, biyolojik problemlerin çözümünde bilişim teknolojilerinin kullanılması esasına dayanmaktadır ve biyolojik olayların moleküler düzeyde açıklanmasına yardımcı olmaktadır. Biyoinformatik, biyolojik bilgilerin yaratılması ve saklanması için veritabanlarının oluşturulmasıdır. Biyoinformatik medikal bilimlerde çok önemli bir rol oynamaktadır. Medikal bilimlerde son yıllardaki uygulamalar gen ekspresyon analizleri üzerine yoğunlaşmıştır. Genellikle farklı hastalıklardan etkilenen hücrelerin ekspresyonları derlenerek, sağlıklı hücrelerinki ile kıyaslanmakta ve aradaki farklılıklardan hastalık teşhisi ve hedef ilaç dizaynında yararlanılmaktadır. Bu sayede ekspresyona uğrayan proteine bağlanabilen bileşiklerin dizaynı ve daha da önemlisi ekspresyon seviyesinde değişime neden olan transkripsiyon regülatörlerinin belirlenmesi mümkündür. Bu bağlamda mikro-array deneyleri gerçekleştirerek, farmakolojik uygulamalarda cevabın değerlendirilmesi ve test edilecek ilaçların toksitesinin tahmininde ön bilgi edinilmesi söz konusudur. Bu derlemede oldukça yeni bir bilim dalı olan biyoinformatiğin tıpta ve farmakolojide kullanımı açıklanmaya çalışılmıştır.
FULL TEXT (PDF): 
PDF icon arastirmax-multidisipliner-yeni-bir-bilim-dali-biyoinformatik-tipta-uygulamalari.pdf
  • 3
41-50
  • Turkish

REFERENCES

References: 

1. Bayat A. Science, medicine and the future: Bioinformatics. BMJ, 2002; 324 p: 1018-1022.
2.
Luscomb
e NM, Greenbaum D, Gerstein M. What is bioinformatics? An introduction and overview. Yearbook ofMedical Informatics 2001; s:83-85.
3.
Telefonc
u A. Biyoinformatik I. Biyoinformatik Lisansüstü Yaz Okulu. 2003; s: 3-20, İzmir.
4. Mutch DM, Wahli W, Williamson G. Nutrigenomics and nutrigenetics: the
emerging faces ofnutrition. FASEB J, 2005; 19: 1602¬1616.
5. Russell RB. Genomics and proteomics: all in the same boat, Genome Biology 2002; 3(10): 4034.
6. Burton H, Stewart A. Nutrigenomics: Report ofa workshop hosted by The Nuffield Trust and organized by the Public Health Genetics Unit London: TheNuffieldTrust2005; 1-26.
7. Kauwell GPA. Emerging concepts in nutrigenomics: a preview ofwhat is to come.
Nutr Clin Pract 2005; 20. 75-87.
8. Feagan L, Rohrer J, Garret A, Amthauer H, Komp E, Johnson D, Hock A, ve ark. Bioinformatics process management: informationflow via a computional journal. Source Code for Biology and Medicine. 2007; 2:9p: 2-3.
9. Buttle AJ. Challanges in bioinformatics, trende Biotechnol. 2001;19, p:159-160.
10. Jain E. A practical Introduction to Bioinformatics, Trends Biotechnol. 2002; 20, p:226.
11. Gastgeiger E, Gattiker A, Hoogland C, Ivanyi I, Apel RD, Bairoch A. ExPASy: The proteomics server for in-depth protein knowledge and analysis. Nucleic Acids Res. 2003; 31:3784-3788.
12. Kumar S. Bioinformatics. http//www.geocities.com/bioinformaticsweb/, 2005.
13. Gatto ML, The changing face ofBioinformatics, Drug Discov. Today 2003; 8, p: 375-376.
14. Doerry E, Douglas SA, Kirkpatrick AE and Westerfield M. Participatory Design for Widely-Distributed
S.D.Ü. Tıp pak.
Derg
. 2009:16(3)/ 41-50
50
Polat, biyoinformatik ve tıpta uygulamaları
Scientific Communities. Proceedings ofthe 3rd Conference on Human Factors and the Web 1997.
15.
Cebec
i Z. Tarım ve Bilişim: Nereden Nereye? Tarımda Bilişim Teknolojileri 4. Sempozyumu Bildiri Kitabı, 2001; s:21-22, Kahramanmaraş.
16.
Çömlekçioğl
u U ve Bayraktaroğlu E. Biyoloji ve Bilişim Teknolojileri, K.S.Ü. Fen ve Mühendislik Dergisi, 2001; Cilt: 4, Sayı: 1, Kahramanmaraş.
17. Gentleman RC, Carey VJ, Bates DM, Bolstad B, Dettling M, Dudoit S. ve ark. Bioconductor: open software development for computational biology and bioinformatics Genome Biology 2004; 5:R80 Volume 5, Issue 10.
18. Collins FS, Morgan M And Patrinos A. The Human Genome Project: Lessons from Large-Scale Biyology, Science 2003; 300,286-290.
19. Hogue CWV. Bioinformatics for Beginners. Trends Biochem. Sci. 2002; 27, 542-543.
20. Brooksbank C, Camon E, Midori AH, Magrane M, Martin MJ, Mulder N, O'Donovan C, Parkinson H, Tuli MA, Apweiler R, Birney E, Brazma A, Henrick K, Lopez R, Stoesser G, Stoehr P. and Cameron G, Nucleic Acids Research, 2003; Vol. 31, No. 1, p:43-50.
21. Critchlow T, Musick R, and Slezak T. Experiences applying meta-data bioinformatics, Information Sciences, 2001; 139,13-17.
22. Harms J, Schuluenzen F, Zarivach R. Protein Structure: experimental and theroretical aspects. FEBS Letters, 2002; 525,p:176-178.
23.
Keski
n Ö, Gürsoy A, Türkay M. K.Ü.'de Biyoinformatikve Bilişimsel Biyoloji, 2003;, s: 21¬22.
24.
Sayitoğl
u M. "Kanser Tedavisine Farmakogenetik Yaklaşım" Türkiye Klinikleri J Med Sci., 2007; 27: 434-441.
25. Hopkins MM, Ibarreta D, Gaisser S, Enzing CM, Ryan J, Matin PA ve ark. Putting pharmacogenetics into practice. Nat Biotechnol 2006;24:403-10.
26. Evans WE, Relling MV. Pharmacogenomics: Translating functional genomics into rational therapeutics. Science 1999; 286:487-91.
27. Cartron G, Dacheux L, Salles G, Solal-Celigny P, Bardos P, Colombat P ve ark. Therapeutic activity of humanized anti-CD20 monoclonal antibody and polymorphism in IgG Fc receptor Fc gammaRIIIa gene. Blood 2002; 99:754-8.
28.
Çırakoğl
u B. Genetik Çağı. Bilim ve Teknik Dergisi, Yeni Ufuklara Eki, 2002; s:1-5.
29.
Tolu
n A. Genetik Çağı. Bilim ve Teknik Dergisi, Yeni Ufuklara Eki, 2002; s:16-19.
30.
Zülâ
l A. Genom Sonrası Tıp, Bilim ve Teknik Dergisi, Yeni Ufuklara Eki,2001;s:13.
31. Tatusovaa TA, Maddena TL. BLAST 2 Sequences, a new tool for comparing protein and nucleotide sequences, ,EPagesE247E-E250.
32. ReffME, Carner K, Chambers KS, Chinn PC, Leonard JE, Raab R ve ark. Depletion of B cells in vivo by a chimeric mouse human monoclonal antibody to CD20. Blood 1994; 83:435-45.
33. National Center for Biotechnology Information News, 2008; Volume 16 Issue 1 p: 2-4.
34. Eklin PL. Primer on Medikal. Genomics; Bioinformatics. Mayo ClinProc. 2003; 78:57-64.

Thank you for copying data from http://www.arastirmax.com